Majalah TEMPO, edisi 7 Desember 1998, di rubrik Kolom, Ulil Absar Abdalla menyampaikan kritik kepada sebagian orang. Ia menginterpretasikan ayat-ayat Alquran tanpa pengetahuan mendalam. Bahkan acap kali menarik garis paralel antara ayat-ayat dan kenyataan politik, demi melegimitasi vested interes kelompoknya.

Salah satu kritiknya, Cak Ulil mengoreksi aktivis KISDI, Ahmad Sumargono yang berprinsip bahwa kata kafir adalah berlainan makna dengan k