Sekolah menengah agama atau biasa dikenal dengan madrasah aliyah ternyata tak mau ketinggalan dari sejawatnya. Mulai tahun lalu, ada empat sekolah yang dijadikan proyek percontohan madrasah bertaraf internasional. Tiga di antaranya madrasah aliyah negeri (MAN), yakni MAN di Pare-pare (Sulawesi Selatan), Pekanbaru (Riau), dan Banjarmasin (Kalimantan Selatan). Satu lagi sekolah swasta, Madrasah Aliyah Nurul Jadid, Paiton, Probolinggo, Jawa Timur.