Lahir di tengah keluarga penggemar berat sepeda motor, sejak masih bau kencur Stoner sudah gemar menunggangi sepeda motor kecil dan belajar ngebut. Ia telah mulai ikut berlomba dengan motor kecil ketika berumur 4 tahun. Pada usia 6 tahun ia telah memenangkan kejuaraan pertamanya di Australia.

Saat berusia 6-14 tahun, Stoner mengikuti lomba di seantero benua Kangguru itu. Bersama ayah, ibu dan kakak perempuannya, ia meninggalkan tanah kelahiran d