MA’RUF Amin berada dalam barisan ulama yang mengecam pernyataan Gubernur DKI Jakarta Basuki Tjahaja Purnama pada akhir September 2016 yang menyinggung Surat Al-Maidah ayat 51. Beberapa hari kemudian, Ma’ruf meneken surat berkop Majelis Ulama Indonesia yang isinya menyatakan Basuki menghina Al-Quran dan ulama.

Dalam demonstrasi "212", Ma’ruf dijadwalkan mengisi khotbah pada salat Jumat yang diselenggarakan di Monas. Belakangan, Ma