7 September 2004 Munir, 39 tahun, meninggal dalam pesawat Garuda GA-974 yang sedang terbang menuju Amsterdam, Belanda. Polisi Belanda melakukan otopsi atas jenazah almarhum.

11 November 2004 Keluarga Munir mendapat kabar soal hasil otopsi di Institut Forensik Belanda (NFI). Ditemukan racun arsenik dengan kadar yang fatal.

18 November 2004 Markas Besar Polri memberangkatkan tim penyelidik (termasuk ahli forensik) dan Koordinator Kontras, U