Setelah enam badan intelijen disatukan di Badan Intelijen Strategis (Bais), Benny Moerdani membagi Bais menjadi tujuh direktorat, yang masing-masing dipimpin jenderal bintang satu. Direktur A menangani bidang dalam negeri, saat itu dijabat oleh Nugroho. Ia pensiun dengan pangkat mayor jenderal. Nugroho pernah menduduki jabatan Jaksa Agung Muda Bidang Intelijen dan Sekretaris Jenderal Departemen Dalam Negeri. Direktur B bidang luar negeri dipimpin