Pernyataan Mahfud Md. itu rupanya membuat gerah Istana Negara. Suatu hari pada bulan April, setelah dia pulang dari perjalanan dinas ke luar kota, telepon di ruang kerjanya berdering. Peneleponnya ternyata Presiden Susilo Bambang Yudhoyono langsung.

Kepada Ketua Mahkamah Konstitusi tersebut, Presiden menjelaskan perihal suara-suara miring yang seolah-olah menuduh dirinya memperlama izin pemeriksaan kepala daerah yang tersangkut kasus korupsi. Pr